Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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