Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms