Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH4Q9UIA0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms