Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLIMQ9NVW2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms