Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms