Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF17Q9BXT8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms