Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSG1Q9BU20 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSG1Q9BU20 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms