Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD9AQ99638 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms