Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMKK2Q96RR4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms