Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms