Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms