Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms