Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM5Q71RC9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms