Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDC42EP5Q6NZY7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP5Q6NZY7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms