Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF38BQ5VTL8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF38BQ5VTL8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF38BQ5VTL8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF38BQ5VTL8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF38BQ5VTL8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF38BQ5VTL8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF38BQ5VTL8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF38BQ5VTL8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF38BQ5VTL8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF38BQ5VTL8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF38BQ5VTL8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF38BQ5VTL8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF38BQ5VTL8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms