Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H13Q5T200 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms