Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CARTPTQ16568 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CARTPTQ16568 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms