Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN9AQ15858 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN9AQ15858 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN9AQ15858 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN9AQ15858 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN9AQ15858 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN9AQ15858 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN9AQ15858 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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SCN9AQ15858 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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SCN9AQ15858 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
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