Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms