Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP1B1Q10567 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms