Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms