Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNB2Q08289 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNB2Q08289 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms