Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF11Q05519 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms