Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ERCC6Q03468 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms