Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms