Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFAMQ00059 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms