Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGDP52209 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGDP52209 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PGDP52209 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGDP52209 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGDP52209 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms