Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms