Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMOD1P29536 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LMOD1P29536 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms