Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms