Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGS1P23219 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms