Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSPP15924 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSPP15924 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSPP15924 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms