Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI3P10071 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI3P10071 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI3P10071 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI3P10071 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI3P10071 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI3P10071 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI3P10071 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI3P10071 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI3P10071 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI3P10071 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI3P10071 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI3P10071 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI3P10071 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI3P10071 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI3P10071 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI3P10071 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI3P10071 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI3P10071 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI3P10071 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI3P10071 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI3P10071 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI3P10071 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI3P10071 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI3P10071 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI3P10071 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI3P10071 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI3P10071 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI3P10071 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI3P10071 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI3P10071 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI3P10071 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms