Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM228BP0C875 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms