Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms