Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN3BO60391 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms