Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIP1O00291 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIP1O00291 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIP1O00291 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIP1O00291 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIP1O00291 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIP1O00291 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIP1O00291 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIP1O00291 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms