Protein–RNA interactions for Protein: O00217

NDUFS8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS8O00217 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS8O00217 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms