Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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