Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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