Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms