Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
LRRIQ1Q96JM4 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
LRRIQ1Q96JM4 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
LRRIQ1Q96JM4 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRIQ1Q96JM4 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms