Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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RABGGTAQ92696 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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RABGGTAQ92696 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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