Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

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Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBR3Q6ZT12 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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