Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
C9orf135Q5VTT2 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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