Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms