Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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SCN9AQ15858 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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SCN9AQ15858 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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SCN9AQ15858 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN9AQ15858 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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