Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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