Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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CDH18Q13634 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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CDH18Q13634 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDH18Q13634 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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CDH18Q13634 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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