Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms