Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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